يتبنى المركز مجموعة من الأهداف التي تتوافق مع استراتيجية الجامعة وأهدافها، والتى يُمكن تلخيصها فيما يلى:-
1- تحقيق مستوى أداء متميز فى إدارة منظومة ضمان الجودة بالجامعة ،للارتقاء بمستوى الأداء المؤسسى من الناحية ( الأكاديمية ، البحثية ، الإدارية و الخدمية) بما يضمن حصول جميع كليات الجامعة ومعاهدها على الاعتماد من الهيئات المحلية والعالمية .
2- المساهمة فى منظومة التخطيط الاستراتيجي للجامعة والكليات والمعاهد ومتابعة تنفيذها .
3- تقديم الدعم الفنى لكليات ومعاهد الجامعة لضمان جودة الخدمة التعليمية المقدمة وتأهيلهم للاعتماد.
4- تنمية قدرات أعضاء هيئة التدريس والهيئة المعاونة والإداريين فى مجال جودة التعليم والاعتماد.
5- إدارة منظومة لمتابعة وتقييم الأداء بكليات الجامعة ومعاهدها طبقاً لمعايير ومؤشرات الأداء الأكاديمى.
6- المساهمة فى إنشاء نظم تكنولوجية تسمح بميكنة إستدعاء المعلومات ودعم إتخاذ القرار .