تُعَدُ نُظُم ضمان الجودة الداخلية هي المظلة التي لابد أن تجرى من خلالها كافة الأنشطة الجامعية. فبدون نُظُم ضمان الجودة الداخلية لا يمكننا التحقق من صحة إجراءاتنا وفعالية أدائنا ومردوده المُرضى لدى المستفيدين من خداماتنا. وقد قطعت الجامعة شوطاً كبيراً في إرساء نُظُم ضمان الجودة الداخلية في جميع كليات ومعاهد الجامعة الذى كُلل بالنجاح في اعتماد عدد كبير من كليات وبرامج الجامعة وإعادة اعتماد عدد من الكليات أكثر من مرة. واستكمالاً لهذه الإنجازات تهدف الجامعة إلى صياغة نظام صارم وموحد لضمان الجودة داخل الجامعة يُدار مركزيا بواسطة مركز ضمان الجودة بالجامعة، ويطبق فرعياً من خلال وحدات ضمان الجودة بالكليات والمعاهد. وتهدف الجامعة من إنشاء هذا النظام توحيد إجراءات وخطوات وتوقيت تنفيذ مراجعات ضمان الجودة الداخلية على مستوى الجامعة، وتوفير قاعدة معيارية سليمة وعادلة لمقارنة النتائج.